轉基因油脂檢測是指檢測由轉基因油料加工而的終端產品中是否含有轉基因分，即使其中已不再含有或檢測不出轉基因分了，仍然需要進行標識。全球近70個國家和地區都已經制定了轉基因產品的標識管理制度，大多數國家采用的是定量標識，即閾值管理，而我國目前采用的是定標識，但定量標識已為世界發展的趨勢。

轉基因分主要表達在蛋白質和氧核糖核酸（DNA）中，而不表達于甘油三酯中。因此，食用油產品中是否還能檢測到殘存的蛋白質和DNA是標識的前提。蛋白質檢測常用免疫學方法，但是油料油脂加工中的加熱、剪切、酸堿理等復雜理往往會破壞蛋白質的高級空間結構，使其含量微乎其微，難以擴增，采用一般方法檢測時往往檢測不到，易造檢測結果假。

相比之下，DNA的一級結構在加工過程中較為穩定，且易于擴增，即使一定程度的降解也不會影響其檢測效果。關鍵是要從油中提取分離得到DNA。以往認為膠油不含DNA，但現在不但能從油、膠油中提取到DNA及其片段，還能從油、臭油中提取到微量DNA片段，從而完轉基因分的檢測。檢測過程分為兩步，先將油脂中DNA轉水相，然后進行濃、純化，以供聚合酶鏈式反應（PCR）擴增檢測。

需要指出的是，雖然油脂中可能檢測到殘留的DNA片段，但在復雜的制煉工序后，油中殘留的DNA已經被嚴重破壞碎片狀，片段很短，分子很小且含量極低，失去了活，通常不存在食品安全問題。因此，高度制的食用油通常是不含轉基因分的。