廣東藥科大學附屬第一醫院消化科-廣東省微生態治療工程技中心下設供篩選與管理部，菌制備與基礎研究部，菌臨床應用與研究部。該中心配備有全球先進的現代化糞菌分離提取實驗室，并擁有標準化的管理系。截至2023年6月30日，該中心已經實施了7622例次的洗滌菌群移植（WMT）手，其中主要疾病包括年孤獨癥、功能胃腸病、炎癥腸病、胃食管反流病、小腸細菌過度生長、2型糖尿病、非酒脂肪肝、皮類疾病、痛風、肝化失代償期等。所有病例均取得了滿意的臨床療效。
該中心的WMT工作于國際領先地位，并吸引了來自Rebiotix和Ferring研究所、北京阜外醫院、湖北省中醫院、都中醫藥大學附屬醫院、南方醫科大學附屬珠江醫院等30家醫院的參觀及進修學習。此外，該中心還為這些醫院提供了洗滌菌群移植指導，幫助它們功建立了菌群移植臨床應用與研究基地。同時，該中心作為區域救援中心，向救援合作單位中山大學附屬第一醫院、廣州醫科大學第一附屬醫院、廣州醫科大學第二附屬醫院、暨南大學附屬紅十字會醫院、蒙古鄂溫克旗醫院等16個單位進行了洗滌菌群移植救援工作，并取得了一致的好評。
此外，該中心還承擔了廣東省重點領域研發計劃項目“重要健康微生菌種定向選育及功能產品研發” (2022B1111070006)的子項目“健康功能微生制劑的效能驗證及高效開發應用”等縱向研究8項，并發表了32篇高水平學論文。此外，該中心還參與撰寫了包括《Nanjing Consensus on methodology of washed microbiota transplantation》、《腸道菌群移植供篩選與管理中國專家共識（2022版）》、《腸道菌群移植臨床應用管理中國專家共識 （2022版）》等國家共識5部。通過這些工作，該中心在微生態治療領域取得了顯著的就，為促進全球微生態治療的發展做出了重要貢獻。