廣東藥科大學附屬第一醫院消化科是廣東省微生態治療工程技中心的下設部門，負責洗滌菌群移植（washed microbiota transplantation, WMT）的供篩選與管理、菌制備與基礎研究、菌臨床應用與研究等工作。該中心擁有全球先進的現代化糞菌分離提取實驗室和標準化的管理系。

截至2022年12月31日，該中心已經完了7079次WMT治療，其中包括年孤獨癥、功能腸病、炎癥腸病、胃食管反流病、小腸細菌過度生長、2型糖尿病、非酒脂肪肝病、皮類疾病（銀屑病、蕁麻疹、過敏皮炎、特應皮炎和疹）、痛風、肝化失代償期等病種，且獲得了滿意的臨床療效。該中心的WMT技于國際領先地位，吸引了Rebiotix和Ferring研究所、北京阜外醫院、湖北省中醫院、都中醫藥大學附屬醫院、南方醫科大學附屬珠江醫院等30家醫院參觀學習，并提供臨床指導，幫助他們建立了菌群移植臨床應用與研究基地。同時，該中心還作為區域救援中心，為中山大學附屬第一醫院、廣州醫科大學第一附屬醫院、廣州醫科大學第二附屬醫院、暨南大學附屬紅十字會醫院、蒙古鄂溫克旗醫院等16個單位提供洗滌菌群移植救援工作，并得到了一致的好評。

此外，該中心還承擔了廣東省重點領域研發計劃項目的子項目，包括“健康功能微生制劑的效能驗證及高效開發應用”等縱向研究。已經發表了32篇高水平學論文，并參與撰寫了包括《Nanjing Consensus on methodology of washed microbiota transplantation》、《腸道菌群移植供篩選與管理中國專家共識（2022版）》、《腸道菌群移植臨床應用管理中國專家共識（2022版）》等國家共識的5部著作。該中心在腸菌移植領域取得了顯著的就，為廣大患者提供了專業的服務。