廣東藥科大學附屬第一醫院消化科-廣東省微生態治療工程技中心下設供篩選與管理部，菌制備與基礎研究部，菌臨床應用與研究部，在全球先進的現代化糞菌分離提取實驗室和標準化的管理系的支持下，截至2023年12月31日，已功實施WMT共9100例次。其中，主要治療的疾病包括年孤獨癥、功能胃腸病、炎癥腸病、放腸炎、胃食管反流病、小腸細菌過度生長、2型糖尿病、非酒脂肪肝、高脂癥、以及多種皮類疾病。經過WMT治療，這些疾病均獲得了滿意的臨床療效。
該中心開展的WMT于國際領先地位，吸引了包括Rebiotix和Ferring研究所、北京阜外醫院、湖北省中醫院、都中醫藥大學附屬醫院、南方醫科大學附屬珠江醫院等30家醫院的參觀及進修學習，并對其進行臨床洗滌菌群移植指導，使其功建立了菌群移植臨床應用與研究基地。同時，作為區域救援中心，該中心還向救援合作單位進行了洗滌菌群移植救援工作，并得到了一致的好評。
此外，該中心還承擔了廣東省重點領域研發計劃項目“重要健康微生菌種定向選育及功能產品研發” (2022B1111070006)的子項目“健康功能微生制劑的效能驗證及高效開發應用”等縱向研究8項，已經發表高水平學論文32篇，參與撰寫了包括《Nanjing Consensus on methodology of washed microbiota transplantation》、《腸道菌群移植供篩選與管理中國專家共識（2022版）》、《腸道菌群移植臨床應用管理中國專家共識 （2022版）》等國家共識5部。該中心的工作在WMT領域取得了顯著就，為相關疾病的治療和研究做出了重要貢獻。