洗滌菌群移植（WMT）是一種新型的微生態治療方法，在廣東藥科大學附屬第一醫院消化科-廣東省微生態治療工程技中心得到了廣泛應用。該中心下設供篩選與管理部、菌制備與基礎研究部、菌臨床應用與研究部，擁有全球先進的現代化糞菌分離提取實驗室和標準化的管理系。

截至2023年6月30日，廣東藥科大學附屬第一醫院消化科已經功實施了7622例次洗滌菌群移植。其中，年孤獨癥、功能胃腸病、炎癥腸病、胃食管反流病、小腸細菌過度生長、2型糖尿病、非酒脂肪肝、皮類疾病（銀屑病、蕁麻疹、過敏皮炎、特應皮炎和疹）、痛風和肝化失代償期是十大主要病種。這些病種在洗滌菌群移植后都取得了滿意的臨床療效。

廣東藥科大學附屬第一醫院消化科在洗滌菌群移植領域于國際領先地位。該中心先后接了來自Rebiotix和Ferring研究所、北京阜外醫院、湖北省中醫院、都中醫藥大學附屬醫院、南方醫科大學附屬珠江醫院等30家醫院的參觀及進修學習，并對其進行了洗滌菌群移植指導，幫助他們功建立了菌群移植臨床應用與研究基地。同時，該中心還作為區域救援中心，向救援合作單位中山大學附屬第一醫院、廣州醫科大學第一附屬醫院、廣州醫科大學第二附屬醫院、暨南大學附屬紅十字會醫院、蒙古鄂溫克旗醫院等16個單位提供洗滌菌群移植救援工作，并獲得了一致的好評。

此外，該中心還承擔了廣東省重點領域研發計劃項目的子項目，已經發表了32篇高水平學論文，并參與撰寫了包括《Nanjing Consensus on methodology of washed microbiota transplantation》、《腸道菌群移植供篩選與管理中國專家共識（2022版）》、《腸道菌群移植臨床應用管理中國專家共識 （2022版）》在的5部國家共識。這些果使得廣東藥科大學附屬第一醫院消化科在洗滌菌群移植領域取得了重要的就。