洗滌菌群移植（WMT）是一種新興的微生態治療方法，由廣東藥科大學附屬第一醫院消化科-廣東省微生態治療工程技中心負責開展。該中心下設供篩選與管理部、菌制備與基礎研究部、菌臨床應用與研究部，擁有全球先進的現代化糞菌分離提取實驗室和標準化的管理系。
截至2023年6月30日，廣東藥科大學附屬第一醫院消化科已經功實施了7622例次WMT治療，其中涵蓋了十大病種。年孤獨癥是最常見的病種，共有3031例次接了WMT治療。其次是功能胃腸病（2749例次）、炎癥腸病（947例次）、胃食管反流病（560例次）、小腸細菌過度生長（544例次）、2型糖尿病（528例次）、非酒脂肪肝（1052例次）、皮類疾病（309例次，包括銀屑病、蕁麻疹、過敏皮炎、特應皮炎和疹）、痛風（155例次）和肝化失代償期（293例次）。這些病種均取得了滿意的臨床療效。
廣東藥科大學附屬第一醫院消化科在WMT方面于國際領先地位。該中心先后接待了Rebiotix和Ferring研究所、北京阜外醫院、湖北省中醫院、都中醫藥大學附屬醫院、南方醫科大學附屬珠江醫院等30家醫院的參觀學習，并為其提供臨床洗滌菌群移植指導，使其功建立了菌群移植臨床應用與研究基地。同時，該中心還作為區域救援中心，向中山大學附屬第一醫院、廣州醫科大學第一附屬醫院、廣州醫科大學第二附屬醫院、暨南大學附屬紅十字會醫院、蒙古鄂溫克旗醫院等16個單位提供了洗滌菌群移植救援工作，并得到了一致的好評。
此外，該中心還承擔了廣東省重點領域研發計劃項目“重要健康微生菌種定向選育及功能產品研發”的子項目“健康功能微生制劑的效能驗證及高效開發應用”等縱向研究8項，已經發表了32篇高水平學論文，并參與撰寫了包括《Nanjing Consensus on methodology of washed microbiota transplantation》、《腸道菌群移植供篩選與管理中國專家共識（2022版）》、《腸道菌群移植臨床應用管理中國專家共識 （2022版）》等國家共識5部。這些研究果對WMT的推廣和應用有重要意義。