兒孤獨癥是一種有生學基礎的心理發育障礙，由多種因素導致，帶有傳易的個在特定環境因素作用下發生的疾病。傳因素是兒孤獨癥的主要病因，而環境因素，尤其是在胎兒大腦發育關鍵期接的環境因素，也會增加發病的可能。
據國家衛生部辦公廳發布的《兒孤獨癥診療康復指南》，近年來，隨著診斷能力、早期干預和康復訓練質量的提高，兒孤獨癥的預后正在逐步改善。一些患兒的認知水平、社會適應能力和社技巧可以達到正常水平。然而，兒孤獨癥的預后到多種因素的影響，主要包括以下四點。
首先，早期診斷和干預非常重要。在發育可塑最強的時期（一般為6歲以前）對患兒進行長期系統的干預，可以最大程度地改善患兒的預后。對于輕度、智力正常或接近正常的兒孤獨癥患兒，早期診斷和干預尤為重要。
其次，早期言語流能力與孤獨癥的預后切相關。早期（5歲前）或在確診為孤獨癥之前已有較好言語功能的患兒，一般預后較好。
第三，病的嚴重程度和智力水平對孤獨癥患兒的預后影響很大。病越重，智力越低，預后越差；相反，病越輕，智力越高，預后越好。
最后，伴發疾病也與孤獨癥患兒的預后相關。如果患兒伴發脆X染綜合征、結節化、神發育遲滯、癲癇等疾病，預后較差。
了解影響患兒預后的因素，并積極采取治療措施，對改善患兒的病和促進患兒的發展有重要意義。據衛生部辦公廳的指南，兒孤獨癥的治療主要以教育干預為主，藥治療為輔。由于患兒存在多方面的發育障礙和緒行為異常，應據患兒的況采用教育干預、行為矯正等綜合干預措施。
干預的原則包括早期診斷、早期干預、長期治療，強調每日干預。對于可疑的患兒，也應及時進行教育干預。科學系統地使用明確有效的方法對患兒進行系統的教育干預，包括針對孤獨癥核心癥狀的干預訓練，以及促進患兒發育、防治疾病、減滋擾行為、提高智能、促進生活自理能力和社會適應能力等方面的訓練。
對于兒孤獨癥患兒在癥狀、智力和行為等方面的問題，應據評估結果進行有計劃的個訓練。對于重度患兒，早期訓練時的師生比例應為1：1。小組訓練時應據患兒的發育水平和行為特征進行分組。
家庭的參與對于孤獨癥患兒非常重要，應給予患兒家庭全方位的支持和教育，提高家庭參與程度，幫助家庭評估教育干預的適當和可行，并指導家庭選擇科學的訓練方法。家庭的經濟狀況、父母的心態、環境和社會支持都會影響患兒的預后。父母要接事實，妥善理患兒教育干預與生活、工作的關系。