中醫與西醫在哲學基礎和方法論上存在著巨大差異，兩者無法簡單地結合起來。正如20多年前英國《新科學家》上講的牛與西紅柿雜一樣，中西醫的結合就像一場愚人節的玩笑，是無法實現的。因此，中西醫只能并存，各有各的優勢，相互補充而又不能相互取代。
對于一些人認為中醫不科學的觀點，很可能是因為他們并不了解中醫，只是覺得誰的聲音高，誰的話就是真理。特別是那些喝足了洋墨水的英，他們多是帶著有眼鏡來看待中醫。他們把中醫的治病效果完全歸功于中藥的作用，卻忽略了中醫的運籌帷幄對中草藥的運用。權威文件上提到要發揚中醫的優勢特，但實際上，優勢與特是兩回事。優勢是指能夠倒對方的有利形勢，中醫有許多優勢，其中之一就是預測未來疾病的發生、質、趨勢。
中醫的五運六氣學說是中醫的華，它可以運用基本原理解釋氣候變化的年度時間規律及其對人健康的影響。例如，據五運六氣，中醫可以預測未來年份疾病的發生、質。比如，在石家莊流行乙腦時，中醫使用了“白虎湯”功制止了疫的蔓延，而在唐山、北京流行同樣疾病時，“白虎湯”卻無效。在這種況下，中醫據五運六氣推測出今年偏，因此加了一味燥藥——蒼，解決了乙腦問題。類似的況也發生在SARS期間，中醫專家據五運六氣預測到疫的結束時間。由此可見，五運六氣學說對于預測疾病的發生有重要意義。
然而，近百年來，中醫到了各種打擊制，五運六氣學說被視為“迷信”。因此，需要重新關注和研究五運六氣學說，而不是拋棄它。2003年SARS的發引起了中醫界對五運六氣學說的重新關注，國家中醫藥管理局也啟了相應的研究。中醫的優勢之一，也正是在于其能夠預測未來疾病的發生、質、趨勢。因此，中醫的五運六氣學說是需要被重視和加以挽回的學說，而不是被拋棄。