《黃帝經》作為中醫藥知識系的重要組部分，深深植于中華民族傳統文化的沃土中。在構建中醫藥知識系時，《黃帝經》應用了先秦五行知識，傳承了先秦諸子所言五行的基本涵和思維模式，并賦予五行以富而全面的生命科學容。這種應用使中醫藥理論有了與現代生學相應合的特，包括基因的自復制和能夠發生非病理和病理的突變。

在《黃帝經》中，五行知識現在中醫藥理論的多個方面。首先，人類生命發生、存在的基礎與五行理論的關系。《經》秉承了“土生萬”的觀念，將土地視為萬發生和存在的必需條件，也將人類有靈的特點與土地聯系起來。這種觀念現了中華民族傳統文化中關于土地和人類之間切關系的傳統觀念。其次，藏象理論建構中的五行知識。在《經》中，通過將事據五行屬進行歸類，構建了五臟的特和相關理論。這種分類方法基于先秦時期的“取象類比”思維和間接推演思維，使得中醫藥理論能夠更好地把握人各個組織結構之間的關系。再次，五臟間相互關系中的五行知識。《經》通過研究五行相生相克的關系，建立了五臟之間的生克制化關系。這種關系在中醫藥理論中起著重要的作用，指導著中醫臨床治療的實踐。此外，質理論中的五行知識、發病和病機理論中的五行知識、診法理論中的五行知識、辨證中的五行知識、治療學中的五行知識、腧及刺治方法中的五行知識，都是《經》中五行知識在不同領域的應用。

總之，《黃帝經》中的五行知識貫穿于中醫藥理論的方方面面，是構建中醫藥知識系的重要思維方法。該知識系既傳承了先秦五行知識的基本涵和思維模式，又賦予其富而全面的生命科學容，使得中醫藥理論能夠更好地解釋和應用于現實臨床實踐中。這種應用不僅現了中醫藥理論對中華民族傳統文化的傳承，也與現代生學的發展相吻合。因此，加深對《黃帝經》中五行知識的理解，對于推中醫藥的發展和應用有重要意義。